“纽带乐队”的首次演出有惊无险地圆满落幕，而四人的悠长暑假也还在继续。后藤独为了与乐队成员们一起度过假期特意空出了时间，这份心意也终于被伙伴们注意到，四人一行在江之岛留下了难忘的回忆。此后，学生们的盛会——校园文化节翩然而至。在筹备文化节时，后藤独很想把握在大家面前表演的机会，犹豫着是否要以“纽带乐队”的名义参加Live表演，但同时她也十分担心因为自己的紧张导致表演出差错，在期待与担忧中徘徊不定难以下定决心。文化节的第一天，伊地知、山田与喜多来到后藤独班级开办的女仆咖啡厅，在伙伴们的陪伴与嬉闹中，后藤独的犹豫心绪也渐渐平复，四人一同积极地准备第二天的登台表演。与乐队的伙伴们相识后，从前孤身一人的后藤独见到了过去从未见过的多彩风景，也在短短的时间内收获了诸多成长。随着第一首乐曲的首个音符奏响，四个女孩的文化节表演拉开帷幕！
在死神界有留克的死神追加了讲述月亮的场面。伊出不登场。随着夜神总一郎心脏病发作的场面被删除，他在第二次基拉事件时看电视的地方也从医院的病房变成了街头。月和L的初次见面的地方变更为放映室。L想到了基拉对第二个基拉的回答。松田误入松柏集团会议室时做弥撒的地方，从工作间改到搜查本部的房间。在雷姆消失的场面中，留下雷姆笔记本的描写和月亮拾到笔记本的描写被删除，第三本笔记本的情节全部被省略，与《光环2》相连接。L的墓前，追加了日本搜查本部的成员宣誓的场面。部分干部的死因，从心脏麻痹一律改为个别死因。三堂从建筑物坠落死亡。纸村伫立在车站的铁轨上，被电车轧死。奈南川是交通事故。
